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GPT-5 作為科學合作夥伴:

8月10日 09:29
我與GPT-5的“Move 37”時刻
今天,我分享我測試GPT-5 Thinking和Pro模型時最非凡的經歷之一。
在我們的實驗室,大約兩年前,我們進行了一系列尖端的免疫學實驗,旨在操控T細胞的能量代謝,這些免疫細胞有能力影響癌症免疫療法、慢性疾病和自身免疫。
我們獲得了令人著迷的結果,但有一個發現仍然無法解釋。幾週的工作讓我們得到了部分解釋,但完整的畫面仍然難以捉摸。
從這些實驗中,我上傳了下面未發表的圖形,並請GPT-5 Pro解釋它。
GPT-5:
✅ 僅從圖形中正確識別了我們的關鍵發現(雖然其他模型也能做到這一點)。
✅ 提出了我們後來執行的確切實驗,這是我們花了幾週時間設計的(o3-pro也曾建議過這一點)。
✅ 最引人注目的是提出了一個最終解釋這些結果的機制!
對我來說,這相當於AlphaGo的傳奇Move 37。
它顯示出AI已經成為頂尖專家和真正的科學合作者,能夠提供真正的洞察。
雖然這些結果尚未發表,但我分享一些GPT-5的輸出作為其他科學家的例子,並展示這將如何顯著加速科學!我還將撰寫並提交這篇論文,並需要在其中承認GPT-5的貢獻!
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來自GPT-5
數據顯示:
• 在第一次激活時短暫的2DG暴露會留下持久的偏移,朝向CCR6+和CD161+表型,並且在重新激活時仍然顯示出增強的IL-17A能力,這在兩週後仍然明顯。
• 這是劑量響應的。從無到3 mM 2DG,CCR6+細胞從約0.7%上升到約12%,CD161+細胞從約1%上升到約21%。IL-17A+細胞總體上從約0.3%增加到約4%,IL-17A信號集中在CCR6+和CD161+區域。
• 僅低葡萄糖(0.5 mM)無法重現該效應。這反駁了簡單的葡萄糖缺乏或降低的糖解作用作為驅動因素。
• CD161的富集強於CCR6,這通常與Th17樣或黏膜/先天樣CD4程序相關。
高層次解釋:
1. 2DG是編程,而不僅僅是急性抑制。在啟動期間的短暫暴露留下了“壓力”的持久記憶,偏向於Th17樣特徵。
2. 機制不太可能僅僅是糖解阻滯。低葡萄糖對照較弱,這將機制推向2DG對蛋白質糖基化和細胞因子受體生物學的影響。
3. 主要機制假設。2DG部分阻止IL-2Rα和其他糖蛋白在啟動時的N-連接糖基化,減少IL-2–STAT5信號,這通常會抑制Th17。在該窗口期減少IL-2的強度會解除對持續存在的CCR6+ CD161+ IL-17能力程序的制約。
4. 替代或補充假設。2DG選擇依賴於較少糖解作用的先前存在的CCR6+或CD161+克隆,而不是新生分化。最終結果是相同的表型,但槓桿是選擇性生存或增殖。
5. 精心計時的2DG“脈衝”可能是一個簡單的旋鈕,以豐富具有更好持久潛力和黏膜歸屬特徵的Th17樣輔助子集。
優先考慮這些:
+D-甘露糖與2DG一起恢復N-糖基化。甘露糖的缺失會影響CCR6/CD161/IL-17A表型。
+甲基丙酮酸或醋酸以繞過糖解ATP/丙酮酸缺陷。這裡的救援將影響能量代謝。
將2DG與糖基化抑制劑tunicamycin和不影響糖基化的僅糖解抑制劑(碘乙酸、PFKFB3抑制劑)進行比較。匹配暴露窗口和劑量。
表面CD25成熟和糖基轉移(PNGase F或Endo H在IL-2Rα上的印跡)。
在啟動後24-48小時進行IL-2脈衝後的pSTAT5。
與IL-2中和或低劑量JAK3抑制進行表型複製。用高IL-2或IL-2突變體進行反向救援。

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