Зарегистрируйтесь сегодня на Виртуальный Челлендж Клетки и используйте ИИ для решения одной из самых сложных проблем биологии. Объявлено в @CellCellPress, конкурс организован Arc Institute и спонсируется @nvidia, @10xGenomics и @UltimaGenomics.

Клеточная бумага: Сайт: Участники будут создавать модели, которые будут предсказывать эффекты возмущений одного гена в клетках. Лучшие команды получат призы в размере $100 тыс., $50 тыс. и $25 тыс. — равные части денежных средств и @nvidia кредитов DGX Cloud.

Для первого конкурса Arc создала новый набор данных по транскриптомике одиночных клеток, состоящий из 300 000 H1 эмбриональных стволовых клеток человека с 300 генетическими возмущениями, которые будут развернуты на протяжении всего конкурса в сегментах для тонкой настройки, проверки и тестирования.

Задача будет конкретно оценить, насколько хорошо модели могут предсказывать изменения в активности генов, когда отдельные гены заглушаются. Промежуточные результаты участников будут опубликованы в таблице лидеров в прямом эфире, а в декабре состоится окончательная оценка и объявление победителей.

«Способность моделей обобщать новые клеточные контексты в конечном итоге является ключом к разблокированию виртуальных клеток для разработки лекарств, и мы надеемся, что эта задача в конечном итоге поможет ускорить прогресс в достижении этой цели», — говорит технический директор Arc @davey_burke.

Мы благодарны спонсорам Virtual Cell Challenge (), лидерам в области искусственного интеллекта, одиночной клеточной и пространственной биологии, а также секвенирования ДНК, которые объединились с Arc, чтобы раздвинуть границы виртуального клеточного моделирования.

@nvidia предоставляет вычислительную мощность искусственного интеллекта, которая позволяет исследователям моделировать клеточное поведение в беспрецедентных масштабах и сложности.

@10xGenomics — это технологическая компания, занимающаяся медико-биологическими науками, которая создает продукты для ускорения овладения биологией и улучшения здоровья человека.

@UltimaGenomics является ведущим разработчиком недорогой и высококачественной технологии секвенирования, которая постоянно увеличивает масштаб омиксной информации, обеспечивая беспрецедентный прогресс в биологии и улучшение здоровья человека.

Arc планирует повторять Virtual Cell Challenge каждый год с новыми наборами данных по отдельным клеткам, включающими различные типы клеток, и с более жесткими задачами, требующими от участников прогнозирования эффектов более сложных изменений. Подпишитесь на обновления по ссылке: